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Pandas加速代碼之避免使用for循環(huán)

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前言

使用Pandas dataframe執(zhí)行數(shù)千甚至數(shù)百萬次計(jì)算仍然是一項(xiàng)挑戰(zhàn)。你不能簡單的將數(shù)據(jù)丟進(jìn)去,編寫Python for循環(huán),然后希望在合理的時間內(nèi)處理數(shù)據(jù)。

Pandas是為一次性處理整個行或列的矢量化操作而設(shè)計(jì)的,循環(huán)遍歷每個單元格、行或列并不是它的設(shè)計(jì)用途。所以,在使用Pandas時,你應(yīng)該考慮高度可并行化的矩陣運(yùn)算。

本文將教你如何使用Pandas設(shè)計(jì)使用的方式,并根據(jù)矩陣運(yùn)算進(jìn)行思考。在此過程中,我們將向你展示一些實(shí)用的節(jié)省時間的技巧和竅門,這些技巧和技巧將使你的Pandas代碼比那些可怕的Python for循環(huán)更快地運(yùn)行!

數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

在本文中,我們將使用經(jīng)典的鳶尾花數(shù)據(jù)集。

現(xiàn)在讓我們建立一個標(biāo)準(zhǔn)線,用Python for循環(huán)來測量我們的速度。我們將通過循環(huán)遍歷每一行來設(shè)置要在數(shù)據(jù)集上執(zhí)行的計(jì)算,然后測量整個操作的速度。這將為我們提供一個基準(zhǔn),以了解我們的新優(yōu)化對我們有多大幫助。

在上面的代碼中,我們創(chuàng)建了一個基本函數(shù),它使用If-Else語句根據(jù)花瓣的長度選擇花的類。我們編寫了一個for循環(huán),通過循環(huán)dataframe對每一行應(yīng)用函數(shù),然后測量循環(huán)的總時間。

在i7-8700k計(jì)算機(jī)上,循環(huán)運(yùn)行5次平均需要0.01345秒。

使用.iterrows()

我們可以做的最簡單但非常有價值的加速是使用Pandas的內(nèi)置 .iterrows() 函數(shù)。

在上一節(jié)中編寫for循環(huán)時,我們使用了 range() 函數(shù)。然而,當(dāng)我們在Python中對大范圍的值進(jìn)行循環(huán)時,生成器往往要快得多。

Pandas的 .iterrows() 函數(shù)在內(nèi)部實(shí)現(xiàn)了一個生成器函數(shù),該函數(shù)將在每次迭代中生成一行Dataframe。更準(zhǔn)確地說,.iterrows() 為DataFrame中的每一行生成(index, Series)的對(元組)。這實(shí)際上與在原始Python中使用 enumerate() 之類的東西是一樣的,但運(yùn)行速度要快得多!

生成器(Generators)

生成器函數(shù)允許你聲明一個行為類似迭代器的函數(shù),也就是說,它可以在for循環(huán)中使用。這大大簡化了代碼,并且比簡單的for循環(huán)更節(jié)省內(nèi)存。

考慮這樣一個例子,我們想把1到1000之間的所有數(shù)字加起來。下面代碼的第一部分說明了如何使用for循環(huán)來實(shí)現(xiàn)這一點(diǎn)。

如果列表很小,比如長度為1000,那就很好了。當(dāng)你想要處理一個龐大的列表時,比如10億個浮點(diǎn)數(shù),問題就出現(xiàn)了。使用for循環(huán),在內(nèi)存中創(chuàng)建了大量的內(nèi)存huge列表,并不是每個人都有無限的RAM來存儲這樣的東西!Python中的range()函數(shù)也做同樣的事情,它在內(nèi)存中構(gòu)建列表

代碼的第(2)節(jié)演示了使用Python生成器對數(shù)字列表求和。生成器將創(chuàng)建元素并僅在需要時將它們存儲在內(nèi)存中。一次一個。這意味著,如果必須創(chuàng)建10億個浮點(diǎn)數(shù),那么只能一次將它們存儲在內(nèi)存中。Python中的xrange()函數(shù)使用生成器來構(gòu)建列表。

也就是說,如果你想多次迭代列表并且它足夠小以適應(yīng)內(nèi)存,那么使用for循環(huán)和range函數(shù)會更好。這是因?yàn)槊看卧L問list值時,生成器和xrange都會重新生成它們,而range是一個靜態(tài)列表,并且內(nèi)存中已存在整數(shù)以便快速訪問。

下面我們修改了代碼,使用.iterrows()代替常規(guī)的for循環(huán)。在我上一節(jié)測試所用的同一臺機(jī)器上,平均運(yùn)行時間為0.005892秒,速度提高了2.28倍!

使用.apply()

iterrows()函數(shù)極大地提高了速度,但我們還遠(yuǎn)遠(yuǎn)沒有完成。請始終記住,當(dāng)使用為向量操作設(shè)計(jì)的庫時,可能有一種方法可以在完全沒有for循環(huán)的情況下最高效地完成任務(wù)。

為我們提供此功能的Pandas功能是 .apply() 函數(shù)。apply()函數(shù)接受另一個函數(shù)作為輸入,并沿著DataFrame的軸(行、列等)應(yīng)用它。在傳遞函數(shù)的這種情況下,lambda通常可以方便地將所有內(nèi)容打包在一起。

在下面的代碼中,我們已經(jīng)完全用.apply()和lambda函數(shù)替換了for循環(huán),打包所需的計(jì)算。這段代碼的平均運(yùn)行時間是0.0020897秒,比原來的for循環(huán)快6.44倍。

apply()之所以快得多,是因?yàn)樗趦?nèi)部嘗試遍歷Cython迭代器。如果你的函數(shù)針對Cython進(jìn)行了優(yōu)化,.apply()將使你的速度更快。額外的好處是,使用內(nèi)置函數(shù)可以生成更干凈、更可讀的代碼!

最后

前面我們提到過,如果你正在使用一個為向量化操作設(shè)計(jì)的庫,你應(yīng)該總是在沒有for循環(huán)的情況下尋找一種方法來進(jìn)行任何計(jì)算。

類似地,以這種方式設(shè)計(jì)的許多庫,包括Pandas,都將具有方便的內(nèi)置函數(shù),可以執(zhí)行你正在尋找的精確計(jì)算,但速度更快。

Pandas的 .cut() 函數(shù)將一組bin定義為輸入,這些bin定義了If-Else的每個范圍和一組標(biāo)簽。這與我們用 compute_class() 函數(shù)手動編寫有完全相同的操作。

看下面的代碼,看看.cut()是如何工作的。我們又一次得到了更干凈、更可讀的代碼。最后,.cut()函數(shù)平均運(yùn)行0.001423秒,比原來的for循環(huán)快了9.39倍!

好了,到此這篇關(guān)于Pandas加速代碼之避免使用for循環(huán)的文章就介紹到這了,更多相關(guān)Pandas for循環(huán)內(nèi)容請搜索腳本之家以前的文章或繼續(xù)瀏覽下面的相關(guān)文章希望大家以后多多支持腳本之家!

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